Sungai ini membekalkan air kepada lima juta penduduk Sydney dan juga menyalurkan pengeluaran pertanian. Ini, digabungkan dengan peningkatan tekanan dari perubahan penggunaan tanah untuk pembangunan bandar, berarti sungai mengalami tekanan yang besar.[petikan diperlukan]

Terdapat sebelas bendungan yang terletak di Sungai Nepean yang secara signifikan mengatur aliran semula jadi. Sungai ini telah tersegmentasi menjadi serangkaian tasik weir dan bukannya sungai yang mengalir secara bebas dan juga dipengaruhi oleh empangan di daerah perairan Upper Nepal.[3]

Wallacia Weir pada mulanya dibina sebagai bendungan kayu untuk John Blaxland kilang tepung di Grove Farm. Langkah ikan Australia yang pertama dibina ketika bendungan konkrit semasa dibina di awal Ngarai Nepean, sebuah pejalan kaki antikendan yang disebabkan oleh kenaikan perlahan semasa Pergunungan Biru orogeny diukir turun melalui batu pasir Hawkesbury yang berusia lima puluh juta tahun].

Pada tahun 1950-an, bangunan Dam Warragamba di seberang jurang curam Sungai Warragamba, anak sungai utama Nepal, menghentikan aliran sebagian besar perairannya dan mengalihkannya untuk memenuhi keperluan kawasan metropolitan Sydney yang berkembang , mengurangkan sungai menjadi bayangan bekas dirinya.[4]

Bendungan dan bendungan ini mempunyai kesan kuat, menyekat ikan asli yang bermigrasi seperti bass Australia (juga biasanya dikenali sebagai hinggap) dari banyak habitatnya sebelumnya, dan mengurangkan banjir dan segar yang diperlukan untuk bertelur. Walaupun begitu, Hawkesbury/Nepean tetap menjadi perikanan bass liar yang penting dan popular.

Tepi Sungai Nep yang lezat menyediakan tempat perlindungan semula jadi bagi flora dan fauna tempatan dan lokasi yang tenang untuk penduduk tempatan bersantai. Di Emu Plains, tebing barat sungai menyediakan lokasi untuk pertunjukan teater luar pada malam musim panas yang hangat. Tebing timur di Penrith menyediakan barbeku kemudahan dan peralatan permainan kanak-kanak, serta jalan yang luas yang berjalan selama beberapa kilometer untuk berjalan-jalan di sepanjang tebing sungai. Tebing timur juga merupakan kediaman Nepean Rowing Club.